«Секретные материалы Чосона» основаны на странных интригующих историях, подробно изложенных в летописи эпохи Чосон. Во всех этих случаях присутствуют элементы сверхъестественного и таинственного, того, что невозможно объяснить с помощью науки. Ким Хён До — государственный инспектор, занимающийся исключительно расследованиями административных преступлений, и это неизбежно приводит его к этим странным загадкам. Хо Юн И — государственная служащая, помогающая ему и пытающаяся понять эти научные невозможности открытой душой в противовес его цинизму.